Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMEB2Q9UKD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms