Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCM8Q9UJA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM8Q9UJA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms