Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRLS1Q9UJA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRLS1Q9UJA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms