Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NPC1L1Q9UHC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms