Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWAP70Q9UH65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SWAP70Q9UH65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWAP70Q9UH65 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms