Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM10Q9UDY6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM10Q9UDY6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms