Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF1Q9UBU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms