Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GULP1Q9UBP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms