Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC6Q9UBN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms