Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRPC4Q9UBN4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms