Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPR1Q9UBH6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XPR1Q9UBH6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms