Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAE1Q9UBE0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms