Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN10Q9UBB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN10Q9UBB4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms