Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHPF2Q9P2E5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms