Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms