Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRNQ9P2B2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRNQ9P2B2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms