Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1BQ9P298 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1BQ9P298 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms