Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIPL1Q9NZN9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIPL1Q9NZN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms