Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MIS18AQ9NYP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MIS18AQ9NYP9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms