Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms