Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKN2AIPQ9NXV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms