Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1Q9NXJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms