Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT1Q9NXH9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT1Q9NXH9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT1Q9NXH9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms