Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CWC25Q9NXE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CWC25Q9NXE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC25Q9NXE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms