Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKS1Q9NXB0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKS1Q9NXB0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms