Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM6Q9NX76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM6Q9NX76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms