Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms