Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBNL3Q9NUK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MBNL3Q9NUK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MBNL3Q9NUK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MBNL3Q9NUK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MBNL3Q9NUK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBNL3Q9NUK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBNL3Q9NUK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms