Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms