Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CISHQ9NSE2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CISHQ9NSE2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms