Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER3Q9NSC5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms