Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOPORSQ9NS56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms