Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PXMP2Q9NR77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PXMP2Q9NR77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PXMP2Q9NR77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms