Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAR1AQ9NR31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms