Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-212ENST00000448926 3629 ntTSL 23.56□□□□□ -1.849e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)4.97□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.746e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)3.95□□□□□ -1.786e-7■■■■■ 29.4
EXOSC5Q9NQT4 EVI5-204ENST00000474806 525 ntTSL 316.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 AFG1L-202ENST00000421954 1741 ntTSL 55.91□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 AFG1L-204ENST00000431865 779 ntTSL 54.69□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 54.83□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.759e-7■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.971e-6■■■■■ 29.3
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 514□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 311.96□□□□□ -0.493e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 310.91□□□□□ -0.663e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 49□□□□□ -0.973e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 58.47□□□□□ -1.053e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 58.14□□□□□ -1.113e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 57.98□□□□□ -1.133e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 46.91□□□□□ -1.33e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 26.8□□□□□ -1.323e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 44.37□□□□□ -1.713e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 EIF4A1-204ENST00000577731 574 ntTSL 23.14□□□□□ -1.913e-11■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-211ENST00000513021 568 ntTSL 47.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)6.15□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-203ENST00000503716 3712 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-220ENST00000484623 852 ntTSL 57.33□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-204ENST00000422222 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.44□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-213ENST00000471681 3120 ntTSL 53.12□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-202ENST00000341455 3042 ntTSL 1 (best)3.06□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.965e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-207ENST00000547317 499 ntTSL 35.47□□□□□ -1.534e-8■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-213ENST00000549268 1087 ntTSL 55.01□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-207ENST00000529949 2116 ntTSL 213.57□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-206ENST00000526404 550 ntTSL 513.1□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-208ENST00000534524 580 ntTSL 39.99□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 ABCB7-210ENST00000620875 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 29.2
EXOSC5Q9NQT4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 39.44□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-202ENST00000380889 1670 ntTSL 1 (best)19.87■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-204ENST00000586025 4022 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-205ENST00000586352 755 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-203ENST00000585442 705 ntTSL 512.61□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-208ENST00000589058 536 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PIN1-210ENST00000591777 533 ntTSL 39.91□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 YTHDC2-203ENST00000506333 784 ntTSL 54.64□□□□□ -1.675e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 PEAK1-212ENST00000569819 466 ntTSL 36.66□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-204ENST00000504029 593 ntTSL 414.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-207ENST00000506985 2399 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 KLHL8-205ENST00000505388 606 ntTSL 43.18□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 59.32□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-203ENST00000564431 743 ntTSL 317.1■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-204ENST00000566931 520 ntTSL 516.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-202ENST00000562880 556 ntTSL 47.15□□□□□ -1.268e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-206ENST00000567485 437 ntTSL 25.74□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.568e-7■■■■■ 29.1
EXOSC5Q9NQT4 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 SLF1-203ENST00000466957 593 ntTSL 53.95□□□□□ -1.788e-7■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 29.1□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 32.59□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 219.57■□□□□ 0.725e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-10■■■■■ 29
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 51.6 ms