Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX9Q9NQ69 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX9Q9NQ69 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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