Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB18Q9NP72 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB18Q9NP72 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms