Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF2Q9HAU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF2Q9HAU5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF2Q9HAU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms