Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC28A3Q9HAS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms