Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHEJ1Q9H9Q4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NHEJ1Q9H9Q4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms