Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVMER34-1Q9H9K5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms