Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPF2Q9H7B2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPF2Q9H7B2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms