Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STN1Q9H668 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STN1Q9H668 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STN1Q9H668 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms