Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SENP3Q9H4L4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SENP3Q9H4L4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SENP3Q9H4L4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms