Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRABDQ9H4I3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms