Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC13Q9H3R2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MUC13Q9H3R2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms