Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP2Q9H2M9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB3GAP2Q9H2M9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms