Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM60Q9H2L4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM60Q9H2L4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms