Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPRTNQ9H040 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRTNQ9H040 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRTNQ9H040 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms