Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SENP6Q9GZR1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SENP6Q9GZR1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SENP6Q9GZR1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms